В коллекции Иконописи собрано значительное количество историко-художественных памятников православной культуры XVIII - XX веков. Коллекция состоит из икон, предметов ДПИ (киоты, оклады) и деревянной скульптуры. Собрание начало формироваться в 1939 году, пополнялась предметами, бытовавшими на территории округа (иконы из деревни Скрипуново Ханты-Мансийского района). Далее в конце ХХ века в начале ХХI предметы иконописи закупались у частных коллекционеров.
В 2005 году при финансовой поддержке ОАО «Ханты-Мансийский банк» была произведена закупка коллекции «народных» икон у коллекционера Быстрова В.Ф. Эти предметы, датируемые ХIХ – началом ХХ века бытовали на территории Тюменской и Курганской областей.
В 2007 году ряд ценных икон закупаются у ООО "Велес". Среди них икона Никола Чудотворец (вторая половиной XVIII - первая половина XIX века), Господь Вседержитель (вторая половина XIX в). В этом же году у коллекционера Козьмин А.А. закупается икона Богоматерь Тобольская (конец XIX - начало XX века).
В коллекции доминируют «крестьянские» иконы выполнение народными умельцами, но также есть произведения, выполненные в иконописных центрах. Представлены образы Спасителя и наиболее почитаемых в Сибири святых Николая Чудотворца, Богоматери Абалакской, Параскевы Пятницы, целителя Пантелеймона, Симеона Верхотурского, Святой Екатерины.
Иконы были высоко чтимы русскими переселенцами осваивавшими Север, поэтому коллекция иконописи, имеющая историко-культурное и искусствоведческое значение одна из ценных в Музее Природы и Человека.